【创科广场】科技园建立生物样本库 生物医学信息共享平台
生物样本库又称「生物银行」(Biobank),主要是标准化收集、处理、储存和应用健康和疾病生物体的生物大分子、细胞、组织和器官等样本,近年扩展至基因组学、蛋白质组学及其他组学资讯的样本。
生物医学信息平台则对未来的医疗数据交换,协助加快技术研究测试。近年医疗业界亦兴起了FHIR(Fast Healtcare Interoperability Resources)「快速医疗互操作性资源」,用于交换电子病历(Electronic health record,EHR)数据格式和数据元,基于HL7制定数据格式标准。长远而言,FHIR亦可改善病人病历管理,加快医疗研究。
香港科技园刚推出全港首个供商业及学术机构,研发生物科技的生物样本库和生物医学信息平台,促进科研合作及商业化。生物医学信息平台则为云端生物科技数据共享平台会开放予园区公司、大学和研究机构使用。
病理和细胞学服务
科技园行政总裁黄克强表示:「香港在引领地区和全球生物科技发展,具有巨大潜力。作为国际城市,香港汇聚顶尖科学家,加上地理位置优越,拥有全面华人医学数据,有助研发适合华裔病人的治疗方案。」
「科学园内约有150家生物科技公司专注研发创新技术。科技园的生物样本库和生物医学信息平台正正为业界提供所需的支援,加快研发步伐。」
生物样本库收集和储存生物样本供研发。全球最早提出的生物样本库,可数建立国家基因库的冰岛,1998年已出Biobank计划,衞生部门数据库储存全国35万公民健康纪录,结合详细家谱与遗传数据库,由deCODE公司为基因排序,构成冰岛生物样本数据库GGPR(Genealogy genotype phenotype resource),找出导致当地人罹患疾病、或是增加罹病机率的基因缺陷。1999年英国亦建立生物样本库,去年亦委托deCODE为英国生物样本库内50万名参与者作基因排序。
此后,日本、爱沙尼亚、美国、德国、加拿大、台湾均建立生物样本库,因为各地遗传基因有其独特性,生活型态与致病因素不同,故此建立专门生物样本库,本港样本库也对华人社会有启示性。
一直以来,香港生物样本库和病理实验室位处医院和大学,不开放予私营生物科技公司作研发。私营公司碍于经济条件,难以建立专属生物样本库。科技园生物样本库亦将推出网上目录,欢迎用户共享样本及使用,促进协作和共同创新。
生物样本库透过从学术及商业机构收集高质量样本,建立储存及共享平台,也提供专为研究项目而设的组织病理学和细胞学服务,例如组织处理、包埋、切片、染色等。实验室设备及运作遵循国际生物样本库指引,包括注册医务化验师操作,确保高质量服务。
数据服务加快创新
生物医学信息平台提供数据目录,供研究人员搜索资料及开展机构内部或机构之间的合作,无需从平台下载数据集,即可视像化、开发和分析平台上数据。平台提供安全可靠的云端数据储存系统和可扩展的运算设备资源,配合生物医药技术分析所需,云端储存和运算资源亦由用户按需要而定。研究人员可在专用的工作空间中创建研究项目,然后采用平台既定的程式进行研究分析,或执行其个人化的工作流程及模式。现时,共有63个研究项目正在平台上进行。
上月,AWS的re:Invent用户大会推出了Healthlake医疗数据服务,供医疗机构或药厂快速存储、标注及标准化病人的医疗数据,以作出更精确诊断和治疗。现时病人的数据分散在多个系统和储存格式,Healthlake可迅速将数据特征标准化(Normalization),更快整合病人的数据,以符合FHIR格式储存,如此一来药物可加快新药研发,从大量统计更快作出效用预测,或者保险公司计算保费。现时病人数据的数据多以非结构方式储存,Healthlake可快速整合多来源医疗数据,以FHIR指定格式存放,供医疗研究人员搜索。



















